Jan Guggenheim wurde 1986 in Duisburg geboren. Er zog in der 9. Klasse nach Israel, wo er sein Abitur machte.
Anschließend ging er zur Vorbereitung auf seine Rabbinerausbildung an eine Jeschiwa. 2012 begann er das Studium am orthodoxen Rabbinerseminar zu Berlin. Nach seiner Ordinierung war er Gemeinderabbiner in Karlsruhe. Von 2017 bis 2021 war er der Gemeinderabbiner der Israelitischen Kultusgemeinde Fürth.